Основне завдання методики – досягнення «стану внутрішньої цілісності». Стан внутрішньої цілісності, максимально повна, гармонійна та ефективна взаємодія різних частин тіла між  собою, в будь-якому положенні тіла в просторі. Замість того, щоб розтягувати частини тіла, окремі м'язи, ми просто балансуємо їх стан відностно інших м'язів.

Стан внутрішньої цілісності це стан , при якому:
- вся рухальна (зовнішня) мускулатура збалансована. М'язи знаходяться в проміжному, середньому стані між повним розслабленням та крайнім напруженням, і робота м'язів антагоністів збалансована між собою.
- всі частини тіла максимально пов'язані між собою за рахунок включення в роботу суглобово-зв'язкового апарату та глибокої дрібної мускулатури.

Ішвара Йога, як методика базується на двох аспектах:
1. Внутрішні принципи роботи з тілом - детальні пояснення того, як правильно виконується будь-яка, окремо взята вправа, рух або полодення тіла в просторі.
2. Принципи побудови тренувальних програм, одного заняття або ж  тренувального процесу вцілому. Вони засновані на детальній класифікації вправ, яка дозволяє точно підібрати набір вправ, максимально ефективний для кожного практикуючого в залежності від його рівня підготовки, фізичних оосбливостей та поставлених задач.